Lastnik Mestnega botaničnega vrta, ki je del Znanstvenih mestnih muzejev, je Občina Trst. Vrt je razdeljen na enote, kot je prikazano na zemljevidu, in obsega tudi naraven rezervat, ki ga tvorita gozdova Biasoletto in Farned v izmeri 90 hektarjev.
Mestni botanični vrt objavlja Index Seminum (seznam semen), v katerem so našteta semena za izmenjavo in so navedeni vsi pripadajoči podatki.
Ta seznam pošiljamo številnim botaničnim vrtovom po vsem svetu za brezplačno izmenjavo semen med znanstvenimi ustanovami.
Mestni botanični vrt opravlja znanstveno raziskovalno delo, skrbi za ohranjanje okolja, prireja pedagoške dejavnosti in omogoča prijetno preživljanje prostega časa. Zadostiti mora potrebam sodobnega raziskovalnega dela, obenem pa želi ozaveščati javnost o naravoslovju, s čimer nudi novo priložnost za kulturno rast vse večjega števila ljudi.
Ustanova ima torej različne vloge: opravlja raziskovalno funkcijo in sistematično klasifikacijo, ohranja, goji in razmnožuje zdravilne, kulturne in užitne rastline, lokalne vrtnine, samoniklo in endemično floro dežele in sosednjih območij, vodne in močvirske rastline ter sočnice. Botanični vrt predstavlja resnično floristično bogastvo in ima strateško vlogo pri ohranjanju biološke raznovrstnosti in posledično človekovega obstoja.
Kadar je vrt, kot v našem primeru, vpet v mestno tkivo, vzpostavlja pomemben dialog z mestnim prebivalstvom, ki želi izboljšati svoje znanje ali preprosto ubežati pred onesnaženim in odtujevalnim mestnim vrvežem.
